主要原因有以下幾點：
 
　　（1）發育不完善：兒童，尤其是嬰幼兒雙眼單視功能發育不完善，不能很好地協調眼外肌，任何不穩定的因素都能促使斜視的發生。人的單視功能是后天逐漸發育的，這種功能建立與視覺功能一樣是反復接受外界清晰物像的刺激，逐漸地發育和成熟起來的。嬰兒出生后2個月只有大體融像，精確融像功能的建立要持續到5歲以后，立體視建立最遲，6～7歲才能接近成人。所以說5歲前雙眼單視功能未完善期間，是兒童斜視的高發期。

　　（2）先天異常：這種斜視多由先天眼外肌肉的位置發育異常，眼外肌本身發育異常，中胚葉分化不全，眼肌分離不良，肌鞘異常及纖維化等解剖上的缺陷或支配肌肉的神經麻痹所致。也有的由于生產過程中，使用產鉗造成嬰兒頭面部損傷或母親生產時用力過度致胎兒顱壓升高產生大腦點狀出血，而出血剛好在支配眼球運動的神經核處引起眼外肌麻痹。此外，也有遺傳因素，斜視眼在家族中遺傳不是全體成員，這種缺陷往往是間接遺傳到下一代子女身上。一般出生6個月內發生斜視稱先天性斜視，它不具備建立雙眼視物的基本條件，對視功能的發育危害最大。

　　（3）眼球發育特點使兒童易患斜視：由于兒童眼球小，眼軸短，多為遠視眼，又因兒童角膜及晶體屈折力大，睫狀肌收縮力強，即調節力強。這樣的兒童想看清物體就需要更多的調節力，同時雙眼也用力向內轉產生了過量輻輳，容易引起內斜視，這種內斜視稱調節性內斜。
 
　　（4）眼球運動中樞控制能力不足：如果集合過強或外展不足或兩者同時存在就產生了內斜；相反外展過強，集合不足或者兩者同時存在，就產生了外斜。