肛瘺的治療原則需根據肛裂發生的機理，以及肛瘺的解剖結構制訂。

　　①清除內口：手術時要找到原發的內口，并把感染的肛竇、肛門腺及其導管切除干凈，這是肛瘺治療的關鍵。

　　②處理好瘺管及支管、死腔：要把瘺管的管道、支管、死腔等清除干凈，以免術后復發。

　　③保留肛管直腸環：肛瘺手術時，應明確診斷，查明內口及瘺管走向，保留肛管直腸環，以維持正常的肛門括約功能。

　　總之，在具體手術操作中，一定要仔細尋找到內口，并防止切斷肛管直腸環。