西醫認為，產生肛裂的病因很多，主要與以下幾種因素有關：

　　(1) 解剖學因素：肛門外括約肌淺層后方附著于尾骨，其肌束向前分成兩條肌束，繞肛管兩側，至肛門前方又匯合附著于會陰體，在肛門前后方各形成一個“Y”形分叉薄弱區；直腸下部走行向前向下，肛管走行向后向下，在連接處形成一個角度，當大便時糞便向下的壓力作用，在肛管后方的壓力最大；恥骨直腸肌大部分附著于肛管兩側，排便時肛管前后間隙的張力較大，肛門外括約肌松弛，肛門內括約肌向下移位，增大了外括約肌的張力。以上幾種解剖原因的綜合作用，造成了排便時肛門后部較前部容易發生裂口，肛門兩側不易發生肛裂。

　　(2) 肛管內病變：尤其是齒線附近組織的炎癥如肛竇炎、肛乳頭炎、內痔發炎等均容易使齒線下的皮下組織感染化膿，皮膚潰爛而形成肛裂。

　　(3) 損傷：損傷是肛裂的直接原因。常見于肛門指診，器械檢查及食物異物損傷所致。尤其是肛門先天性發育不完全者，更易造成損傷。

　　(4) 括約肌痙攣：排便時肛門外括約肌皮下層過早地出現痙攣，肛門外括約肌淺層前后無組織支持的“Y”形薄弱區，易遭受損傷而致肛裂。