我國是流腦的高發地區，每8—10年出現1次周期性流行高峰，發病率比國外高4—25倍。近30多年來的資料說明A群菌一直是我國流行的優勢菌，發病率在非流行年為3—10/10萬，小流行年為30—50/10萬，大流行年高達l00一500/10萬以上。人口密集地區，每隔3—5年出現1次小流行，8一10年有1次大流行。而邊遠山區、偏僻農村或海島等人口稀少地區，可能10—20年不出現病例，但一旦有傳染源輸入，常引起暴發流行，1個自然村約流行1—2個月，1個鄉l一2年，1個縣可在所屬各鄉輪回流行2—3年，1個省從始發地區擴散蔓延至全省，常需3—4年后才流行終止。全國發病高峰期內各省有先有后，局部地區經流行后人群抗體水平上升而使發病下降。幾年后由于新生兒的累積，隱性感染或菌苗接種者抗體水平下降，人群易感性上升而引起再度流行。一個流行期約歷時4—6年，如此循環不息，明顯表現出流腦流行的周期性特點。

　　流腦流行的第二特征是具有明顯的季節高峰。我國A群菌無論在流行年或散發年均以冬春季多發。每年11—12月發病上升，3—4月達高峰，5月、6月下降，7—10月罕見發病者。高峰期2—4月的病例數占全年病例的60%一90%。

　　發病率最高的是兒童，15歲以下患者占總數的80%以上。年齡越小發病率越高。在大城市新生兒至6歲組的患兒常占全部病例的40%一60%。而農村8個月以下的嬰兒和7一l0歲的學齡兒童是發病的兩個高峰。在流行上升年份人群易感性高，則呈現發病年齡向大年齡方向移動。這是流行的第三特征。

　　在流腦發病的性別分布上，男女之比無差異，帶菌流行率男女也相仿。